近日速石科技与深势科技宣布,共同部署完成了基于云平台的高通量自由能微扰计算方案。该方案以速石科技一站式新药研发云平台fastone为基础,融合深势科技Hermite™药物计算设计平台,能够自动化弹性调用超过百张GPU卡进行Uni-FEP计算任务,显著提升新药早期研发效率。目前,这一方案已在加科思药业正式启用。
本次联合方案部署融合了速石科技与深势科技两方的技术优势,强化了药企内部研发能力。
- Uni-FEP,即深势科技自研的FEP计算解决方案,它将自由能微扰理论、分子动力学、增强采样算法与高性能计算相结合,适用于骨架跃迁、配位共价、电荷转移、大环成环等不同场景,以高精度计算替代部分合成实验,从而提升药企在先导化合物优化阶段的研发效率。
- fastone平台核心是速石科技自研的一套即开即用的新药研发环境,深势科技Uni-FEP模块完全部署在fastone平台上,部署周期极短,能够实现新药研发企业对全部数据的自主管控能力。fastone平台能根据Uni-FEP任务需求,提供自动化弹性伸缩的动态GPU集群,在大规模并行任务提升计算效率的同时,实现成本控制的目标,并能基于任务层面监控告警功能,及时掌握Uni-FEP运行状态。同时,本次方案建立在速石科技完整的安全保障体系之上,通过统一认证,全通道数据加密,数据隔离,数据传输审计,运维监控等多重安全措施,更好地保护药物研发数据资产,从技术架构上保障药企信息安全。
加科思药业临床前研发执行副总裁龙伟博士表示,药物分子与靶标蛋白的结合与相互作用是现代药物发现的重要基础之一,但其预测的精准度也制约着药物分子的快速筛选与设计。速石科技与深势科技分别是CADD平台整合与FEP精准计算领域的先行者。通过这次合作,加科思将充分发挥这两个领域的技术优势与资源,加速推进分子发现,攻克更多难成药靶点。
深势科技创始人兼CEO孙伟杰表示,加科思药业在创新药研发方面具备全球领先的技术积淀,借助本次合作,我们将高精度的Uni-FEP计算工具融合速石科技在云平台方面的技术实力,能够在保持计算精度的同时具备高度弹性的计算能力,让自由能微扰计算真正在实际的管线研发中发挥作用,提升先导化合物优化阶段的研发效率,助力加科思药业攻克更多难成药靶点。速石科技创始人陈熹表示,利用计算机技术辅助药物研发,是生命科学行业的一个长期发展趋势,随着国内从事创新药研发的企业增多,研发管线的整体增加,AI辅助药物研发逐渐从梦想步入现实。对漫长药物研发周期的不满,对更多算力的渴求,对数据安全、系统安全的要求提高,都是药企需要面临的挑战。这次与深势科技在加科思药业的合作,就是一个很好的里程碑事件。
▎关于加科思药业
加科思药业(1167.HK)致力于为患者提供突破性治疗方案,公司的愿景是与合作伙伴携手共进,成为全球认可的药物研发领导者。公司的实验室坐落于中国北京、上海和美国马萨诸塞州,实验平台拥有开发蛋白磷酸酶、KRAS和其他转录因子的变构抑制剂技术。关于加科思的更多信息,请访问:http://www.jacobiopharma.com/
▎关于深势科技
深势科技成立于2018年,是AI for Science科学研究范式的先行者,致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题,为人类文明最基础的生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。Hermite™是深势科技打造的基于人工智能、物理建模和高性能计算的新一代药物计算设计平台,致力于为药物研发工作者提供一站式解决方案。Hermite™以网页应用的形式,提供多种药物设计功能,帮助药物设计人员完成从靶点结构解析、预测与精修,到苗头化合物筛选,再到先导化合物优化和性质预测的一体化工作,提供友好的可视化交互界面、功能实时更新,同时支持本地和云上的私有化部署。关于深势科技的更多信息,请访问:https://dp.tech/
▎关于速石科技
速石科技(fastone)致力于构建为应用定义的云,让任何应用程序,始终以自动化、更优化和可扩展的方式,在任何基础架构上运行。
我们为制药企业、Biotech公司提供一站式新药研发云平台,基于本地+公有混合云环境的灵活部署及交付,帮助用户提升10-20倍业务运算效率,降低成本达到75%以上,加快市场响应速度。我们提供生命科学行业应用的分析与加速,通过Serverless框架屏蔽底层IT技术细节,实现用户对本地和公有云资源无差别访问。关于速石科技的更多信息,请访问:https://fastonetech.com/
- END -
我们有个新药研发云平台
集成多种生命科学领域应用,大量任务多节点并行
应对短时间爆发性需求,连网即用
跑任务快,原来几个月甚至几年,现在只需几小时
5分钟快速上手,拖拉点选可视化界面,无需代码
支持高级用户直接在云端创建集群
扫码免费试用,送300元体验金,入股不亏~
更多电子书欢迎扫码关注小F(ID:iamfastone)获取
你也许想了解具体的落地场景:
这样跑COMSOL,是不是就可以发Nature了
Auto-Scale这支仙女棒如何大幅提升Virtuoso仿真效率?
1分钟告诉你用MOE模拟200000个分子要花多少钱
LS-DYNA求解效率深度测评 │ 六种规模,本地VS云端5种不同硬件配置
揭秘20000个VCS任务背后的“搬桌子”系列故事
155个GPU!多云场景下的Amber自由能计算
怎么把需要45天的突发性Fluent仿真计算缩短到4天之内?
5000核大规模OPC上云,效率提升53倍
提速2920倍!用AutoDock Vina对接2800万个分子
从4天到1.75小时,如何让Bladed仿真效率提升55倍?
从30天到17小时,如何让HSPICE仿真效率提升42倍?
关于为应用定义的云平台:
解读Hyperion年度报告:脱离场景谈用量就是耍流氓
这一届科研计算人赶DDL红宝书:学生篇
一次搞懂速石科技三大产品:FCC、FCC-E、FCP
AI太笨了……暂时
【2021版】全球44家顶尖药企AI辅助药物研发行动白皮书
国内超算发展近40年,终于遇到了一个像样的对手
帮助CXO解惑上云成本的迷思,看这篇就够了
花费4小时5500美元,速石科技跻身全球超算TOP500