应用简介

"结构就是功能"——蛋白质的工作原理和作用取决于其3D形状。​2020年末，基于深度神经网络的AlphaFold2，一举破解了困扰生物学界长达五十年之久的“蛋白质折叠”难题，改变了科学研究的游戏规则，可以从蛋白质序列直接预测蛋白质结构，实现了计算机蛋白质建模极高的精确度。

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LeDock是一款分子对接软件，专为快速准确地将小分子灵活对接到蛋白质而设计，对接时间最快仅需3秒。该应用同时支持Windows、Linux和MacOS三大操作系统。

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MOE（Molecular Operating Environment）是加拿大化学计算集团公司ChemicalComputing Group Inc.开发的一套计算机辅助药物分子设计的平台。

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基于分子动力学拟的炼金术自由能计算是提高我们对各种生物过程的理解以及加快多种疾病的药物设计和优化的关键工具，Amber是其中的常用软件之一。

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AutoDock Vina是用于分子对接和虚拟筛选的开源程序，是目前使用广泛的分子对接软件之一。