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Amber分子自由能计算,20小时155个GPU计算Amber分子动力学模拟力场

应用简介:

基于分子动力学拟的炼金术自由能计算是提高我们对各种生物过程的理解以及加快多种疾病的药物设计和优化的关键工具,Amber是其中的常用软件之一。

实证简述:

某高校研究所有大量任务需要使用Amber18进行自由能计算,使用本地仅有的1个GPU需要至少4个月才能完成。fastone为用户在短时间内调度了云端155个GPU,并自动监控用户提交的任务数量和资源的需求,动态按需地自动化开启与关闭所需算力资源,提高GPU资源利用率。针对Amber18使用GPU计算存在一定概率失败的问题,fastone自动定位任务并按需开启CPU资源,对该任务自动重算,直到计算完成为止。

详情参见白皮书正文。

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